其实，对李渊来说，这么做已经是考虑到天子的“金口玉言”了，毕竟以辩论分胜负是他亲口降旨的，那场辩论在长安城已是尽人皆知，成为街谈话议的热门话题。身为皇帝，若在这个时候沙汰佛教，岂非自食其言？现在把道教连坐，佛道二教一起沙汰，且又以“正本清源”、“兴隆佛法”为由头，听起来总归要好听一些。
但皇帝还是觉得此举有些亏负道教，因此在朝堂之上再次重申道先佛后的秩序，为防僧人抗议，又降旨道：
“语诸僧等，明诏既下，如也不伏，国有严科。”
高压之下，大多数僧人采取了“饮气吞声”的作法，不敢多说什么。
只有智实法师拒不奉诏，慨然道：“吾固知势不可为，所以争者，欲后世知大唐有僧耳！”
结果，皇帝当场翻脸，并赐下八十廷杖。
智实被抬到大觉寺时已是奄奄一息，从颈下到小腿，一片血肉模糊。弟子们想给他清洗伤口，包裹一下，却发觉这根本难以做到。
天气闷热，智实法师脸色腊黄，嘴唇焦干，浑身汗透。玄奘束手无策地坐在一旁，只能替他轻轻擦去额上的汗水，又将清水一点点喂到他的口中。
许久，智实才终于睁开眼睛，看着眼前还略带几分稚气的年轻法师，轻轻问道：“玄奘……你……还想……去天竺……取真经吗？”
面对生命垂危的大师，玄奘没有说话。
“佛弟子……不打妄语……你……怎么想的……就……怎么说……”
“是的。”玄奘轻声答道。
智实苍白的脸上露出一丝笑容，他艰难地说道：“玄奘……你……你是……对的……只有将……真正的佛法……带到……中原……才能解除……佛门……之灾厄……”
说到这里，他重重地喘了几口气：“只可……惜……老衲……年事已高……否则……便与奘师……同去……也好过……留在长安……徒逞……匹夫之勇……终究……终究难以……改变……”
他的声音越来越微弱，生命之火似已燃到了尽头。嫂索行者玄奘
玄奘含泪道：“大师什么都不要想了，一切自有缘法。大师现在专心念佛，玄奘为你助念。”
智实闭上眼睛：“好……念佛……念佛是……不会……有错的……阿弥……陀……佛……”
玄奘与其他众僧团团围坐在智实身边，为他助念。在众多僧人庄严而又整齐的佛号声中，智实终于安详地舍报离世。
佛号声中，玄奘轻抬衣袖，擦去眼中涌出的泪水。
虽然他知道，在修道人的眼中，生与死之间是没有多少界限的，但还是难以抑制心中的悲伤。
“玄奘，不必难过，”道岳法师的眼睛看着智实，轻轻说道，“恩怨既了，牵挂再无，他也可以安心去了！生与死本就是定数，又有几人能够看透？阿弥陀佛！”
说罢，法师双手合十，双目微闭，默颂佛经。