其实这种分歧只是兵种不同造成的，并不是什么大的问题。从作战角度来讲，海军的战争准备主要是只在基地保持一定的兵力和充实的战略物资，因此即使撤销一度准备好的战备也比较容易，所以海军有把战争准备看得比较简单的倾向。
陆军的准备则是首先要动员大批兵力，然后将其集结到预想的战场附近，把它展开。同时还要对敌人的动向进行严密的监视，从而制定详细的作战计划，过程极为繁琐。并且还需要天皇陛下以及全体国民的支持，远比海军要复杂费力的多。所以从手续上也需要首先确定国策，然后取得政府的同意。
另外，根据历来的经验，在外交决裂的最后关头，海军有可能不下决心开战而中途退出，陆军对此十分担心。因此陆军主张现在先下定对美英一战的决心，在这个决心之下同时进行战争准备和外交工作，外交谈判一旦决裂就决心开战。
1941年1月2日和3日两天，陆海军部局长等继续举行会议，对开战决心问题进行讨论。正如陆军部预料的那样，海军军务局长坚决不同意决心开战，而且表示即使在外交谈判决裂的情况下，也还要考虑欧洲的形势才能决定开战。
因此，尽管海军部提出了对南太平洋地区动武的方案，并且还提出了五个实施的办法，但是陆军部对于海军首脑究竟有没有对美一战的决心还是很怀疑。因此，陆军提议，将“决心开战”修改为“在战争的决心之下”。但是冈军务局长就连这样也拒不接受，到了1月4日，才表示如果修改成“在不惜一战的决心之下”便可以接受。
这样才使得日军海军部与陆军部在关于是否开战间题意见趋于一致，并且商定了具体的时间，在关于什么时候与英美等国开战这个问题上，海陆军倒是很一致，都认为必须在8月上旬左右。
然而，为了完成这一战争准备，需要使航空大部队进驻法属印度支那南部，而且还需要把大型运输船队集结在南中国海。陆军认为，这些措施应在决心开战之后实施，决心开战前的准备工作应以不妨碍外交谈判为限度。即陆军主张，应该在行使武力之前适当的时机确定开战决心，然后再过渡到正式的作战准备，其时机应定在5月上旬。时此，陆海军之间取得了一致意见。
1月5日，大本营陆海军部之间的意见已经完全一致，关于是否继续与美国谈判，海陆军都一致认为可以继续与美国接触。对于外交谈判的条件，海陆军原则是认为应该尊重历来的日美谅解方案的宗旨，态度较此前强硬了不少。
同时，海陆军还要求政府方面立即着手战争扩大的相关准备，从人力财力物力上保证大日本帝国在“逼不得已”的情况下对英美法荷开战。并且还为政府方面提供了一份所需物资的清单，要求政府方面在5月底之前将清单上的物资全部准备妥当！