清咸丰年间，莲性寺毁于兵火，清光绪年间再次重建。重建后的莲性寺主要有：大雄宝殿、天王殿、藏经楼、云山阁、白塔及僧房。
寺院四面环湖，左有五亭桥。右有藕香桥，后有白塔，是瘦西湖上之名刹，亦为湖之胜景。法海寺在湖水南岸，寺门朝东，建筑在一处高岗上。山门前。有一截高台阶，在山门两旁的台阶上植有松柏，台阶两侧各有一尊可爱的小沙弥石雕。
四外树荫前也有一群形态各异，调皮玩耍的小沙弥石雕。扫地、玩耍、读书、参禅的小沙弥。寺庙内的佛像、法器、家具等被破坏殆尽，殿宇堂榭亦年久失修，破败不堪，原祗陀林住持宽敬老和尚发愿重修法海寺。
莲性寺新建的山门殿前为两层平台，下一层作花坛，上一层平台边缘两侧建白石栏杆。每根栏柱上都雕有石狮，每边八个。
平台上有两棵老桧柏，正中置一长方形铁香炉，香炉上铸“法海寺”三字。山门殿两侧砌八字墙，山门上方嵌一块“法海寺”石额，为镇江焦山茗山法师所题。门旁设一对莲花门枕，黄墙红门，上盖绿色琉璃瓦。
中三间为天王殿。正中长方形佛台上供奉大肚弥勒佛。弥勒佛后供奉护法韦驮菩萨，门楣上方悬挂黄底黑字天王殿匾额。弥勒佛两侧塑供四大天王。这四尊天王与别处稍有不同，手持法器更是有别。
没有琵琶和宝伞，多了一柄大斧。山门殿后两侧各植一株银杏，北雌南雄。再后便是佛殿楼和客堂。现寺内有尼姑约10人，住持宽敬。新的大雄宝殿，殿宇宏伟。妙相尊严、金碧辉煌、佛地重光。“大雄宝殿”匾额为著名佛学家、原华国佛教协会会长赵朴初所题。
大雄宝殿楹联：晨钟暮鼓警醒世间名利客，经声佛号唤回苦海迷路人。大雄宝殿佛光普照匾额下方供奉着三世佛，中间是金碧辉煌的释迦牟尼如来佛，两侧为和蔼慈祥的药师、弥陀佛高踞莲花宝座之上。
佛祖后不是常见的大型海岛观音菩萨群雕，只是观音菩萨与善财童子与小龙女。左边供奉着身骑青狮的文殊菩萨。专司智德。右边供奉着骑白象的普贤菩萨，专司理德。弥陀授手万修万人去；众生起行一念一佛来。
佛念众生众生在佛心内；众生念佛佛在众生心中。寿无量愿无量光明无量；愍有情觉有情接引有情。殿内有根据观天量寿佛经的内容和故事绘画而成的大型壁画“经变图”，全部采用天然玉石制成，在全国寺庙中十分罕见。
晨钟暮鼓警醒世间名利客，经声佛号唤回苦海迷路人。极乐慈尊垂法手接引众生同归极乐；婆娑教主广长舌开示群蒙早出婆娑。佛殿北门上嵌石额“法海”，陈延韡书。
一旁立有“重修法海寺碑记”。佛殿之北有五楹云山阁。寺西南筑一座面朝东北的半间碑亭，内有乾隆题诗御碑：一朵花宫结净因，周環绿水漾波新。歌台画舫何妨闹，恰是亭亭不受尘。丁丑春二月御笔
御诗写的是白塔旁边的法海寺不受凡尘的打扰，在美丽的瘦西湖畔静心向法。莲性寺东南有“藕香桥”通往“叶园”。藕香桥为砖石拱桥，原名“法海桥”。始建于明朝嘉靖四年，后经扬州卫指挥重建。
清朝莲花新河未开之时，船只需经“法海桥”下才能驶往平山堂。
“法海桥”整修，桥上石阶重新铺设，桥栏由石制改为混凝土制，柱头饰莲花，桥下湖道遍植荷花，桥名改为“藕香桥”。现今“莲性寺”南又新建木质梁桥一座。
如今的法海寺不仅为扬州瘦西湖增加了一个新的景点，也为香客和信众提供了一个清净、安宁和修行的好场所。
据说法海寺里的和尚烧猪头肉非常在行，清代扬州八怪之一的罗聘有诗云：“初打春雷第一声，雨后春笋玉淋淋。买来配烧花猪头，不问厨娘问老僧。”赞的就是乾隆年间扬州第一个烧猪头拿手的老和尚。
和尚烧猪头好像很有传统，朱自清在他的《扬州的夏日》里，也念念不忘扬州瘦西湖法海寺老和尚的烧猪头。法海寺最有名的白塔在寺院之北巍峨矗立，高耸入云，系在旧塔基上重建而成。
塔形如锥，金瓶之下有宝盖，四周有缨络围绕，塔铃高悬，清风徐来，泠然有声。宝盖之下，为“十三天”，又名“十三层”，系佛家语。塔身中空，南向壶门内，原供有白衣大士像，今已不知所藏何物，门虽设而常关。
法海寺白塔是按京城北海的白塔仿建，已有近两百年的历史。塔身为砖石结构，外敷白，分三层，上层叫刹，中层是龛，均呈圆形，下层是塔基，为正方形。
白塔属喇嘛塔，系藏传佛教喇嘛教寺院里的塔制，在瘦西湖中也仅作为点缀而已。塔高27.5米，外形轮廓线比北海白塔清瘦修长。
白塔通体皆白，分为三层：下层为基座，座上有承托塔身的覆莲座与金刚圈。中层为龛室，形如古瓶，南面设眼光门，内供白衣大士像。
上层为圆锥形塔刹，有13层瘦长的圆圈相轮，象征佛教‘十三天‘。刹顶置六角形宝盖，角悬风铃，上托铜质葫芦塔顶。
白塔基座中央是砖雕束腰须弥座，八角四面，每面三龛，龛内雕刻十二生肖像，象征一年12个月，一天12个时辰。底层为方形台基，四周围有栏板。柱头皆雕石狮，形态各异。
前置小台，台北及两侧皆筑阶梯，可以登人。光绪年间重修时，铺设