与姬轩辕同一年代，九黎族人那边也出现一个天才，名叫“蚩尤”。蚩尤将九个强大的部落合并成为一个大部落，称为九黎部落。每个部落有九个氏族，以自己为首，共八十一个兄弟，都是酋长，而蚩尤是大酋长。他们信奉“巫”教，杂拜鬼神，而蚩尤便是他们部落最大的“巫”。他对第三眼的掌控已经到了很高的境界，传说他用第三眼直视敌人，可以让敌人头晕目眩，无法进行战斗，他被称为“天下第一巫神”。
据传四大部落：燧人以木为兵，神农以石为兵，九黎以金为兵，有熊以兽为兵。天下总归要一统，四大部落相持百年后，再次开始了相互吞并。
首先是神农部落内部出现分裂，由于对于种植的庄稼分配不公平，很多依附于神农部落的小部落开始离心离德，渐渐不服从于神农部落，而神农部落也对这些小部落进行镇压。这些小部落被镇压之后，表面屈服，而暗地里偷偷联络有熊部落，表示自己要转投于有熊部落。
姬轩辕得知神农部落内部情况后，果断出兵和神农部落在阪泉之野进行了大规模的战斗，终于在“阪泉之战”之后收服了神农部落，让神农部落臣服于自己。
而蚩尤也对燧人部落进行了突袭，黑夜对于燧人部落的人来说是黑暗，是不能视物、不便行动的时刻。而对九黎部落“巫”们的行动丝毫没有影响，他们利用黑夜的掩护对燧人部落进行了夜袭。
燧人部落以木制的棍棒为武器，本就不是以青铜器为武器的九黎部落的对手，再加上黑夜的他们的限制，他们很快惨败下来。到了天亮的时候，燧人部落已经完全被九黎部落的族人占据。
只是在对待燧人俘虏的处理问题上，在九黎部落内产生了很大的分歧，一部分人认为燧人部落是“火祖”的后裔，而“火祖”对于人类的贡献非常巨大，应该要厚待他们。而另一部分表示不同意，燧人部落被自己部落的人偷袭而败，心怀怨念，日后必反，如果他们暗中和有熊部落窜通起来，那么九黎部落将步神农部落的后尘。
两方各持己见，相持不下，最后请“大巫”蚩尤来定夺。而蚩尤在获得第三眼能力之后，已经不再看得起其他部落的族人，他觉得只有拥有第三眼的九黎族人才是人上人，其他族群的人都是下等的人甚至和养的牲口没有区别。他下了一个残忍的命令，不但将燧人俘虏全部灭杀，而且将他们作为自己部落的食物来处置。
这决定让一部分九黎族人看清了蚩尤凶狠的面目，寒了心，其中有两族的部分族人则离开了蚩尤，追随姬轩辕西迁于潞国，不再以九黎为姓氏符号，而改为“中黎氏”。最后这两族分别成为“杨”姓和“姜”姓……
说到了这里，二郎终于明白自己拥有第三眼的原因，也明白了殷郊为什么会有第三眼，因为殷郊的母亲是姜王后。殷纣王的父亲是“帝乙”，他见识到闻太师第三眼的能力之后，非常羡慕。就开始为自己的子孙谋划，最后让自己的儿子殷纣王娶了有“中黎氏”血脉的姜王后为妻，并生下了殷郊。帝乙的谋划很成功，他的长嫡孙果然拥有第三眼，但是他万万没有想到的是，他的儿子却要把这个拥有第三眼的长嫡孙砍头。迫使他的长嫡孙跑到仙人小镇去了……
“爹，你说我们杨氏，是九黎部落的后裔？”二郎忍不住打断了杨天佑的讲述。
杨天佑点了点头，说道：“我也是从家族留下的典籍记载中才知道这些事情。”
“那你为什么要我找轩辕剑呢？”对于这个问题二郎很是疑惑，为什么师父和父亲都要自己去找轩辕剑。那个和九黎部落似乎没有什么关系。
杨天佑解释道：“九黎以金为兵，是最早使用青铜器的部落。轩辕剑虽然以姬轩辕为名，但实际是蚩尤的随身兵器，只是蚩尤死后，被姬轩辕所得而已。”
“原来是这样。”二郎终于明白了，不过他还有疑问继续问道：“只是这把对我有什么用呢？”
杨天佑转头看着二郎额前的竖纹，慢慢地说道：“传闻蚩尤佩戴的兵器里有他所创的第三眼功法！”
二郎听闻之后，感觉自己的心跳都加快了很多，他本以为自己获得《天眼通》功法后，第三眼的修炼已经算是到头了，没想到世间还有比《天眼通》更厉害的功法。
“爹，那轩辕剑会在什么地方呢？”二郎迫不及待地问道。
杨天佑笑了笑，说道：“你还是先听把我这个故事讲完吧……”
在姬轩辕获得了阪泉之战的胜利后，蚩尤也成功歼灭了燧人部落，所以蚩尤和姬轩辕将不可避免会有一战，这一战将决定中原的归属。
蚩尤率领的军团那时候已经会使用铜制的长矛和大刀，已经是那个时期最精良的武器，而且他的八十一个兄弟，个个勇敢强悍，传说他们都是铜头铁臂，刀枪不入的怪物。
姬轩辕对蚩尤的军团特点进行了分析，最后采用了骑射战术，避免了和蚩尤族人的短兵相接，他们以机动性强和远射能力精准的特点，来对抗蚩尤军团的强悍体制和精良武器，获得了奇效，蚩尤军团还在未接近轩辕军团的时候，就已经被射杀大半，剩下的兵士在对方骑兵轰杀下，被打得节节败退。
蚩尤军团与轩辕军团经历了三年的战争，打了九次大战役，在屡战屡败之后，已经所剩兵力已经不多。他们最后败退到了涿鹿。涿鹿这个地方长