京都的战事可谓异常的激烈，无论是守卫京都的大军，还是进行攻城的大军，双方可谓是你来我往势均力敌。
原本在诸葛墨到达之后，率领扶桑大军进攻战局一度偏向进攻一方，当时诸葛墨的机关兽发威，几乎要攻破京都的大门，拿下那座京都城的城门。
但是关键时刻，鲁修斯安排的机械兵团出现，硬是将机关兽给击退，迫使进攻方功亏一篑，整个战局可谓是瞬间逆转。
机械兵团在斯科特的指挥下，可谓是势如破竹，直接杀出城去，追杀进攻一方的大军许久，简直要将那些胆敢进攻京都的大军给彻底击溃。
好在诸葛墨早有安排，成功在城外的几里之外布置了一个大阵，大军退入到大阵之中，以东方的阵法抵挡住了机械兵团。
但是尽管如此，诸葛墨想要一鼓作气攻克京都的计划却泡汤了，那些木下秀吉原本麾下的家臣们，开始对进攻京都的计划产生了一些质疑，觉得不应该继续强行进攻京都。
一时之间，那些大名和诸葛墨之前爆发起一场激烈争论，期间中臣廉足又趁机笼络到更多的支持者，逐渐开始掌控木下秀吉留下军队的大部分权力。
不过，中臣廉足是个非常谨慎的家伙，他很清楚木下秀吉最信任的几名家臣手中，还掌握着相当一部分兵力。
而且诸葛墨看似损失惨重。可是他手上的机关兽仍旧还剩下不少，中臣廉足很清楚自己还不足以对抗终于木下秀吉的家臣，更加不可能会是诸葛墨的对手。因而他始终继续保持着缄默。
对于忠于木下秀吉那批人和诸葛墨之间的矛盾，他更是选择视而不见，任由双方在明面上争斗不休。
只可惜，中臣廉足原本的如意算盘，却因为一场意外的突袭落空，那场意外的突袭也在此改变整个战局。
忠于木下秀吉的几人之中，有一个是被伊贺家逐出门户的家伙。他在和诸葛墨争论过后，居然选择率领麾下忍者前去偷袭。想要突破诸葛墨布下大阵之外，那些围攻他们的京都攻出来的大军。
原本在所有人看来，这是自寻死路的做法，但是让所有人万万没有料到。那家伙居然真的成功得手。
原来，京都内部其实也并不团结，被天皇破格提拔，并且手握大量兵力的丰臣日吉丸，和德川家彦以及太原雪斋都很不对付。
在丰臣日吉丸眼里，德川家彦和太原雪斋不过是仗着出生好罢了，他觉得自己应该拥有比两人更加强大的实力，也认为自己的统兵手段强过两人。
在京都被围攻的期间，他就一直想要表现自己。想要在天皇面前表现出，自己拥有压倒德川家彦和太原雪斋的实力。
只是结果因为机械兵团的出现，使得他的风头被抢了。机械兵团的强横实力，直接将机关兽大军给攻破，解除了京都破城的危机。
对此，便是天皇都亲自向斯科特表示感谢，并且亲自赐给斯科特一个扶桑的姓氏和名字，算是对他机械兵团解救京都畏难的嘉奖。
也正是因为天皇给斯科特的嘉奖。彻底刺激了丰臣日吉丸，他不顾所有人的反对。执意率领大军追击诸葛墨等人，并且在诸葛墨所布置的阵法外面，扎营围攻诸葛墨他们，想要立功向天皇再次证明自己的能力。
结果让她完全没有料到的是，木下秀吉的那位忍者出生的家臣出击，率领忍者夜袭了他的营地，直接将他的大营给攻破。
若不是他的几名忠诚的家将拼死护卫，恐怕他连自己的性命都可能会交代掉。
而险中逃生的丰臣日吉丸，并没有组织众人撤退，反倒是重新组织起大军，打算和那群忍者拼杀，更是想要趁机攻入对方的大营去，以获得属于自己的荣耀。
结果可想而知，他组织起了人手进行反击，但是已然是无法对抗那些忍者，又一次被忍者给杀败，导致麾下大军损失更加惨重。
若不是机械兵团及时赶到，恐怕最终可能真的会全军覆没，即便是机械兵团赶来了，也只来得及救下丰臣日吉丸，以及他身边所剩无几的将士。
在面对诸葛墨机关兽开道，叛军趁势的追击下，机械兵团也不敢正面对抗，斯科特只能是命令机械兵团，护着丰臣日吉丸剩下的大军，向着京都且战且撤。
当然有机械兵团在，最终诸葛墨他们的追击没有能够成功，但是京都又再次被大军围困，而京都原本取得的优势，也随之全都付诸东流，京都的战事重新陷入到僵局。
尽管保住了丰臣日吉丸麾下部分兵力，可是机械兵团在和机关兽的对抗中，也受到了一定的打击，使得机械兵团的战斗力受损，只能是选择固守京都城，让机械兵团趁机可以休整一下。
实际上，机械兵团的损耗，大部分都是在护送丰臣日吉丸等人撤退的时候，与那些机关兽硬拼的时候受到的损伤。
而且，斯科特并不想让机械兵团的机械战士被对方抓住，因为担心诸葛墨会得到鲁修斯的制造技术，所以在机关兽试图擒下机械战士的时候，另一些机械战士又会回头去救援。
有一些来不及获得救援的机械战士，更是直接启动自毁装置，这也使得机械战士的损耗增加，反倒是已经渐渐无法威胁到机关兽。
再次率领大军回到京都城下，诸葛墨没有着急下令进攻，反倒是派出小股的攻城小队，与机关兽配合起来连番攻城，目的就是要消耗城内的战斗力，让京都城的战力